Ortaöğrenimini Trabzon'da tamamladıktan sonra Ankara Üniversitesi Dil, Tarih, Coğrafya Fakültesi'nden mezun oldu. Dil bilimi alanında master ve doktora çalışmalarını tamamlayan Dr. Mustafa Aydın Türk Silahlı Kuvvetleri bünyesindeki çeşitli yurt içi görevlerinden sonra sahasında ülkemizi temsilen 1983-1986 yılları arasında yurt dışı görevlere atandı. 1995 yılında hizmet süresini tamamlayarak Türk Silahlı Kuvvetleri'nden emekli oldu ve aynı yıl yardımcı doçent olarak İstanbul Üniversitesi'nde öğretim üyeliğine başladı. Akademik çalışmalarına halen devam etmektedir.

İki dil bilen, 4 eseri yanında çeşitli gazete, ansiklopedi ve dergilerde yazıları yayımlanan, yurt içinde yurt dışında birçok konferans veren Dr. Mustafa Aydın; evli ve 3 çocuk sahibidir.